Når de først er opført, har geotermiske kraftværker meget lave vedligeholdelsesomkostninger (omkring 6-18 øre per kWh, hvilket er det beløb, som kan sammenlignes med kulkraftværker).
Taler vi om ulemperne ved geotermisk energi, er det bedst at starte med at sige, at geotermisk energi kun er økonomisk fordelagtig i områder, hvor der er et tilstrækkeligt omfang af varm klippegrund i en dybde, som er passende for boring.
Boringen må desuden udføres overordentlig forsigtigt, så skadelige gasser ikke frigøres fra undergrunden, hvilket kunne medføre betydelige miljømæssige skader.
Installationsomkostningerne er en af de hovedsagelige grunde, til at geotermisk energi ikke som energikilde nyder større popularitet verden over. Ifølge nutidig data koster et gennemsnitligt geotermisk kraftværk omkring 15.000 per installeret kilowatt, omkring det dobbelte af hvad et naturgaskraftværk koster (7.000-9.000 kr. per installeret kilowatt). Adskillige faktorer er ansvarlige for disse store omkostninger, deriblandt udgifterne forbundet med boring og udgifterne til de geologiske undersøgelser og tests, som er påkrævede forud for opførelsen af geotermiske kraftværker.
Geotermisk energi er ej heller den bedste løsning for tætbefolkede områder, eftersom installationen af geotermiske anlæg kræver store områder og lange rør, hvilke forudsætninger ikke er rigeligt forekommende i tætbefolkede områder.